Dans le livre et le film de David Attenborough, Une vie sur notre planète, le célèbre biologiste souligne que nous vivons à une époque d’extinction. Alors qu’Attenborough fait principalement référence au fait que nous, les humains, sommes responsables d’une extinction sans précédent de la vie sauvage, il en va de même pour l’extinction de la vie bactérienne dans et sur notre corps.

Alors que nous nous sentons sentimentaux vis-à-vis de la biodiversité dans la nature, par exemple lorsque nous pensons aux pandas ou aux dauphins, nous avons tendance à être beaucoup moins sentimentaux vis-à-vis des espèces bactériennes. Néanmoins, il existe de très bonnes raisons de conserver la diversité des bonnes bactéries dans nos intestins.

Une alimentation riche et saine est bonne pour notre microbiome

Plusieurs études ont comparé le microbiome des personnes aux États-Unis et en Europe au microbiome des personnes vivant en Afrique qui suivent le mode de vie traditionnel des chasseurs-cueilleurs. La conclusion générale est que les microbiomes africains présentaient une richesse et une biodiversité microbiennes plus élevées, et que cette diversité intestinale est associée à une alimentation variée qui comprend de nombreux fruits et légumes frais différents. En comparaison, le microbiome des personnes qui suivaient un régime occidental moins riche, riche en aliments transformés et pauvre en fibres, était moins diversifié.

Les personnes en forme et en bonne santé ont un intestin sain avec un microbiome riche et diversifié. Une mauvaise diversité bactérienne est donc associée à une mauvaise santé.

Pourquoi la diversité intestinale est-elle importante ?

De nombreuses études scientifiques et cliniques dans le monde montrent de plus en plus de preuves que les personnes en forme et en bonne santé ont un intestin sain avec un microbiome riche et diversifié. En revanche, un manque de diversité bactérienne est associé à une mauvaise santé. Dans un environnement malsain où la diversité naturelle a été détruite, par exemple par une mauvaise alimentation ou une utilisation excessive d’antibiotiques, des bactéries nocives peuvent provoquer des maladies. Cette situation est comparable à la destruction de la merveilleuse biodiversité des récifs coralliens.

Perte de diversité et pourquoi c’est importantAlors pourquoi vivons-nous dans une ère d’extinction en ce qui concerne notre microbiote intestinal ? Il y a deux raisons principales, toutes deux liées au style de vie dit « moderne » :

des niveaux accrus d’hygiène, d’assainissement et des progrès médicaux tels que les antibiotiques. Celles-ci ont sans aucun doute aidé l’humanité à réduire massivement le nombre d’infections nocives et dangereuses. Cependant, dans cette « lutte contre les microbes », nos sociétés modernes sont également entrées dans un « environnement stérile » malsain, avec l’effet malheureux (et involontaire) de tuer également de nombreuses bonnes bactéries.
Perte de diversité dans notre alimentation. — Les régimes « occidentaux » modernes ont tendance à reposer sur des aliments hautement transformés qui ne sont pas très variés et ne contiennent que des glucides simples. Ces « régimes malsains » sont très pauvres en fibres complexes et manquent de la variété d’aliments frais nécessaires pour nourrir et maintenir un microbiome intestinal sain. Et un intestin malsain est généralement malsain pour notre santé et notre bien-être en général.

La diversité semble être la clé !

La diversité de votre microbiome est bonne et prévient les maladies. La variété peut être augmentée en mangeant une grande variété de fruits et de légumes et moins de glucides simples. Essayez d’éviter la farine blanche ou le sucre. Plus nous mangeons de matières végétales fraîches et saines, plus les bactéries du microbiome seront diversifiées. Alors que les antibiotiques peuvent sauver des vies, l’excès d’antibiotiques et notre obsession de l’hygiène et de la lutte contre les microbes peuvent également être préjudiciables. Il peut donc être sain de s’exposer occasionnellement à la saleté. Par exemple, le jardinage peut augmenter la diversité du microbiome du jardinier.

La phrase finale du livre « Diet Myth » du scientifique et médecin Tim Spector est : « Et la variété semble être la clé ! ». Tout comme un écosystème plus diversifié est un écosystème plus sain… un microbiome plus diversifié est aussi un microbiome sain !

Références sélectionnées

Attenborough, D. a. A life on our planet : my witness statement and vision for the future.

Spector, T. D. a. The diet myth : the real science behind what we eat. Updated edition

O’Keefe, S.J.D et al (2015) Fat, fibre and cancer risk in African Americans and rural Africans.Nature Communications, Vol: 6:6342 . doi: 10.1038/ncomms7342

Schnorr, S.L., et al., Gut microbiome of the Hadza hunter-gatherers. Nat Commun, 2014. 5: p. 3654.

Pasolli, E., et al., Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Revealed by Over 150,000 Genomes from Metagenomes Spanning Age, Geography, and Lifestyle. Cell, 2019. 176(3): p. 649-662 e20.

De Filippo, C., et al., Impact of diet in shaping gut microbiota revealed by a comparative study in children from Europe and rural Africa. Proc Natl Acad Sci U S A, 2010. 107(33): p. 14691-6.

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